El operativo, realizado al mediodía fue dispuesto por el juez federal Sergio Torres, que tiene en sus manos la denuncia radicada la semana última por la diputada nacional Elisa Carrió contra los ex ministros de Defensa del kirchnerismo Nilda Garré, Arturo Puricelli y Agustín Rossi, a quienes acusa de administración fraudulenta, cohecho y tráfico de influencias a raíz de la reparación de media vida a la que fue sometido el submarino entre diciembre de 2008 y junio de 2014 en el Complejo Industrial y Naval Argentino (Cinar).
El allanamiento se extendió a las oficinas de la empresa Ferrostaal Argentina, que se ocupó del replacado y reparación integral de las 960 baterías del ARA San Juan, que desapareció luego de reportar problemas, justamente, en el compartimento de baterías. Los agentes que participaron del operativo también se llevaron documentación de la sede de esta compañía, ubicada en el barrio de Monserrat.